La Empresa Pública Municipal de Agua Potable y Alcantarillado del Cantón La Troncal, nace en sustitución de la Unidad de Agua Potable y Alcantarillado, con personería jurídica, autonomía administrativa, económica y patrimonial. mediante expedición de ordenanza publicada en el Registro Oficial Nº 319 de fecha 04 de mayo de 2001.

Originalmente el Directorio, se integró por cinco miembros: El Alcalde, un edil designado por el Consejo Cantonal, un edil que haya tenido mayor votación, un representante de los usuarios electo cada dos años y un técnico designado por el alcalde.

La naciente empresa, contaba con un mínimo de personal técnico de campo, siendo su primer Gerente, el Ing. Jaime Roberto Zambrano, en esa época el Dr. Pedro León Panchana operaba la Planta de Tratamiento Copalillos en Cochancay, cuya capacidad estaba en los 80lts/seg.

Al cabo de 19 años de vida institucional, la empresa ha crecido y se ha fortalecido siendo gestora de importantes obras que, en la medida del esfuerzo y gestión de sus directivos, se han concretado en beneficio para la ciudadanía.

El gran desafío de la empresa durante todos estos años, ha sido procurar la dotación permanente del líquido vital a una población cada vez más creciente, teniendo como obstáculo las limitadas y lejanas fuentes de captación, lo costoso del mantenimiento y ampliación de los sistemas de captación, conducción, tratamiento y distribución de agua.

En el 2006 en la Administración del alcalde Sr. Jaime Oswaldo Serrano con el Gerente de EMAPAT-EP Ing. Milton Eduardo Ruiz Correa, adquieren un camión y una camioneta, comformando el parque automotor de la empresa. En el 2015, en la administración del alcalde Sr. Amadeo Pacheco, (con la gestión anticipada realizada por el Ing. Ruiz) durante la Gerencia del Ing. Luis Yugcha, se adquirió una retroexcavadora Caterpillar 416, en diciembre de 2015.